内容来源：OpenScience
功能性磁共振成像预处理流程的一致性
在神经影像学领域，有众多的工具和软件可以进行磁共振成像的预处理，但对预处理方法的选择并没有一个统一的共识，从而影响了研究结果的可重复性。
基于这一问题，在本次报告中，报告人将分享他们针对五个常用的磁共振成像预处理流程（ABCD-BIDS、CCS、CPAC、DPARSF和fMRIPrep）的比较结果。研究发现，由于处理流程所采用的方法不同，即使在处理同样的数据时，最后也会导致结果大相径庭。
为了方便其他研究者更好地复现不同的预处理配置，报告人也会介绍他们开发的可配置性处理流程C-PAC（Configurable Pipeline for the Analysis of Connectomes, https://fcp-indi.github.io/），用C-PAC近乎完美复现了ABCD-BIDS、CCS、fMRIPrep的处理结果。
通过本次报告，希望研究人员能够对基本预处理步骤对结果造成的影响这一问题，更为重视。
报告信息
题目：功能性磁共振成像预处理流程的一致性
报告语言：中文
分享嘉宾：黎欣惠博士（佐治亚理工学院）
佐治亚理工学院生物工程及电子计算机工程交叉学科项目博士生，佐治亚理工学院/埃默里大学计算神经工程项目学者。曾在纽约儿童心理研究所担任科研工程师，从事神经影像预处理软件C-PAC的开发工作。个人主页：https://xinhuili.github.io/
摘要
When fields lack consensus standards and ground truths for their analytic methods, reproducibility tends to be more of an ideal than a reality. Such has been the case for functional neuroimaging, where there exists a sprawling space of tools from which scientists can construct processing pipelines and draw interpretations. We provide a critical evaluation of the impact of differences observed in results across five independently developed functional MRI minimal preprocessing pipelines. We show that even when handling the same exact data, inter-pipeline agreement was only moderate, with the specific steps that contribute to the lack of agreement varying across pipeline comparisons. Using a densely sampled test-retest dataset, we show that the limitations imposed by inter-pipeline agreement mainly become appreciable when the reliability of the underlying data is high. We highlight the importance of comparison among analytic tools and parameters, as both widely debated (e.g., global signal regression) and commonly overlooked (e.g., MNI template version) decisions were each found to lead to marked variation. We provide recommendations for incorporating tool-based variability in functional neuroimaging analyses and a supporting infrastructure.
文章链接：https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.12.01.470790v1
时间
北京时间[GMT+8] 3月5日(周六) 21:00~22:00
欧洲中部时间[CET] 3月5日(周六) 14:00~15:00
美国东部时间[EST] 3月5日(周六) 08:00~09:00
zoom信息
Meeting ID: 9139 4010 836
报告流程：报告50分钟，提问10分钟
主持人：王鑫迪（博士）北京慧脑云
其它：本次线上报告录屏会在结束后上传于B站:COSN_liv https://space.bilibili.com/252509184
组织团队(按名字首字母倒序排列)
OpenScience学术策划小组
张晗(博士), A*STAR, Singapore
张磊 (博士), University of Vienna, Austria
楊毓芳(博士), Freie Universität Berlin, Germany
杨金骉, MPI Psycholinguistics, the Netherlands
王鑫迪(博士), 北京慧脑云
王庆(博士), Montreal Neurological Institute, Canada
金淑娴, Vrije Universiteit Amsterdam, the Netherlands
金海洋(博士), New York University Abu Dhabi, UAE
胡传鹏(博士), 南京师范大学
葛鉴桥 (博士), 北京大学
高梦宇(博士), University of Utah, USA
耿海洋(博士), 香港大学
陈妍秀(博士), 中科院心理所
NeuroChat团队
张文昊(University of Chicago, USA)
张洳源(上海交通大学)
张磊(University of Vienna, AUT)
应浩江(苏州大学)
徐婷(Child Mind Institute, USA)
王鑫迪(北京慧脑云)
滕相斌(MPI for Human Development, DEU)
鲁彬（中国科学院心理研究所）
孔祥祯(浙江大学)
胡传鹏(南京师范大学)
邸新(New Jersey Institute of Technology, USA)