内容来源：OpenScience

手把手教你使用fmriprep预处理核磁功能数据和T1结构数据

本教程主要依据fmriprep给出的官方教程【1】，以及将原始安排成BIDS数据结构的Heudiconv的官方教程【2】，再加上自己的铁头尝试整理而出，其中包括了两个docker包给出的标准流程以及自己在安装和使用过程中遇到的一些注意事项，本文的成功测试平台为Linux（Ubuntu 20.0），在windows上也进行了测试，但是在使用heudiconv时遇到了一些问题（主要是路径挂载问题,这个问题我会后续继续测试的，如果测试成功，还是更希望大家使用这个包来组织BIDS），因此，在windows环境下我使用了另一个包Bidscoin【3】来组织BIDS数据。这个包在使用过程中也有一些问题，在后面我会一一提到（我也尝试自己写代码来组织BIDS数据结构，但是这个结构中涉及多个部分，自己写太容易出问题了，而且时间成本较大，不推荐自己写，针对这个问题出了这么多工具包其实也可以看出，并不是一个轻松就可以解决的问题）。如果在本教程使用时发现新的问题，希望可以先通过自己的努力尝试解决，这样可以更快理解这个过程，如果解决不了，大家可以一起来讨论。最后的最后，强调一下，Linux仍旧是使用fmriprep最容易成功使用的平台。